19年后，印第安納瓊斯博士（Harrison Ford飾）再次啟程，旨在將埃克托王國(guó)遺失的水晶骷髏頭骨歸還原地——傳說中，歸還圣物者將被賜予巨大力量。 在瓊斯的老友奧克斯發(fā)現(xiàn)水晶頭骨前，這一切還只是傳說。可奧克斯之后卻不知何故喪失了心智，并落入蘇聯(lián)特工隊(duì)的手中。為首的冷酷女間諜艾瑞娜（Cate Blanchett飾）深深著迷于所謂的神秘力量，她脅迫瓊斯一行人與其共同前往亞馬遜流域，找尋失落的黃金城埃克托王國(guó)。 在秘魯密林，瓊斯等人和蘇軍展開酣暢淋漓的戰(zhàn)斗，其間還伴隨著沼澤、食人蟻、原始土著攻擊等致命威脅，在他們歷經(jīng)千難萬(wàn)險(xiǎn)，最終踏入密室的那一刻，世界上最奇異的景象出現(xiàn)了……